Яблучне зерня: проект Альфа

Розгорнута в іншій серії подій, ця історія не відповідає канону попереднього фільму Appleseed (незважаючи на те, що її режисером був той самий режисер попередніх фільмів); це альтернативна історія їх початку. Бріареос уже кіборг і не відокремився від Деунана, щоб пізніше возз’єднатися на Олімпі, щоб приєднатися до ESWAT. Appleseed Alpha зображує перші дні Деунана Кнута та Бріареоса у 22 столітті, коли вони вирушають у подорож дистопічними руїнами Нью-Йорка в пошуках міста Олімп. Їх найняв Два Рога, воєначальник зруйнованого міста, щоб знищити двоногі бойові машини. Під час бою вони стикаються з Іріс і Олсоном, обидва на місії. Деунан і Бріареос дружать з ними і вирішують приєднатися до їх місії. Айріс доручено не дати зловмисному кіборгу Талосу заволодіти секретною зброєю, створеною людьми. Талос використовує Айріс, щоб активувати гігантську бойову машину.