Повернувшись із літніх канікул, учні класу 3-E престижної середньої школи Кунуґіґаока опиняються перед майже нездоланними труднощами. Зіткнувшись із загрозою повного знищення світу, школярі змушені вигадувати все більш витончені й винахідливі способи вбити свого вчителя — хитрого, але водночас оптимістичного й завжди готового допомогти Коро-сенсея.
Утім, усунення Коро-сенсея — не єдина мета, про яку варто турбуватися учням. Гакуходзу Асано, нещадний і жорстокий директор академії, прагне завадити успіху класу 3-E, промиваючи мізки іншим своїм працьовитим вихованцям і перетворюючи їх на безжально конкурентних навчальних машин. У повітрі починає витати ворожість, адже як зрадники, так і наймані вбивці намагаються привласнити нагороду за голову Коро-сенсея собі.
Наґіса Шіота, один із найвправніших убивць класу 3-E, опиняється в самому центрі цього конфлікту. Поки він намагається зберегти свою академічну успішність і запобігти кінцю світу, сімейні справи ставлять під загрозу його місце в класі 3-E. Разом зі своїми відданими однокласниками тепер він мусить зустріти загрози віч-на-віч.