Після смерті Юкішіро Томо, Хімура Кеншин став вільним мечами, що володіє, щоб захистити членів Ішина Шиші. Шисіо Макото став його наступником як тінь Хітокірі (вбивця) і відповідав за вбивство Ізуки, людини, яка зрадила Шиші.
Майбутній уряд Мейдзі був більш таємним щодо Шишіо, ніж Кеншин; Багато членів Chōshū та Clans Satsuma (члени майбутнього уряду Мейдзі) мали б про нього дуже мало інформації. Пізніше новий уряд Мейдзі вважав, що в їх інтересах буде усунути Шишіо, перш ніж він став занадто потужним, оскільки Шисіо був людиною, яка бажала влади. Таким чином, під час війни в Бошині Шисіо був без свідомості кількома вогнепальними пострілами, затьмареними нафтою і спалений живим новим урядом, утвореним Ішином Шисі. Він вижив, завдаючи серйозної шкоди всьому тілу. Після цього він зібрав групу найкращих бійців Японії, яка називається Юппонгатана (десять мечів), щоб скинути уряд Мейдзі.
Шисіо передбачав, як японська, яку він керував, виконуючи принципи природного відбору, або те, що він назвав "сильним їсти слабке". Використовуючи цю віру, він проводив кампанію проти уряду Мейдзі, оскільки вважав, що це занадто слабке, щоб ефективно очолити країну. Використовуючи свій девіз, він формував ідеологічного учня з Сета Сджіру, який служив його правою людиною, і найсильніший з Юппонатани. Він планував зміцнити економіку з нафтою, як тільки він взяв на себе країну.